Väčšina zrejmých anatomických homológií je medzi anatomickými štruktúrami, ktoré daný druh aktívne používa, ale niektoré anatomické homológie zahŕňajú štruktúry, ktoré už nie sú potrebné, ale ktoré úplne nezmizli. Pozostatkový orgán alebo štruktúra je orgán alebo štruktúra nájdená v druhu, ktorý sa nepoužíva ako v iných druhoch. Na rozdiel od všeobecného presvedčenia nie sú pozostatkové orgány a pozostatkové štruktúry nevyhnutne zbytočné alebo nefunkčné.
Pozostatky neznamenajú zbytočné alebo nefunkčné, pretože je ťažké dokázať, že nejaká konkrétna štruktúra je nefunkčná. Je možné, že niektoré pozostatkové orgány sú nefunkčné, ale vedci a biológovia to tak dogmaticky nepredpokladajú. Všetko, čo je potrebné na to, aby bol orgán alebo štruktúra označený ako „pozostatkový“, musí byť homológia u iných druhov, v ktorých je použitie alebo funkcia jasná, ale to isté použitie alebo funkcia nie je prípad príslušného druhu. Použitie môže byť nepárne alebo to jednoducho ešte nie je možné identifikovať.
Veľryba panvovej kosti
Príkladom takejto štruktúry je panvica veľrýb. Všetky tetrapody (vrátane veľrýb) majú panvové kosti. U väčšiny zvierat sú panvové kosti potrebné, aby mohli pohybovať dolnou alebo zadnou sadou končatín za účelom pohybu. U niektorých druhov, ako sú veľryby, tieto končatiny väčšinou neexistujú, aj keď ich zvyšky môžu zostať.
Napriek tomuto nedostatku potreby pre nich veľryby stále panvovej kosti. V porovnaní so svojimi náprotivkami iných zvierat sú pomerne malé, ale existujú. Možno slúžia nejakým funkciám, napríklad pomáhajú podporovať reprodukčnú anatómiu veľrýb, existuje však veľa rôznych typov štruktúr, ktoré by sa na takúto úlohu lepšie hodili.
Otázkou je, prečo by veľryba, ktorá nemá dolné končatiny a nepotrebuje pohyb panvových kostí, mala panvové kosti, ktoré sú homológne s tvormi, ktoré potrebujú pohyb panvových kostí? Podobné homológie existujú pre hady a jašterice beznohé. Jediným vysvetlením, ktoré má zmysel, je opäť to, že tieto bytosti sa vyvinuli zo spoločného predka spolu so všetkými ostatnými tetrapódmi.
Ľudský dodatok
Ďalším bežným (a často nepochopeným) príkladom je príloha. U ľudí má doplnok málo zjavnej funkcie, hoci sa teraz zdá, že môže ukladať niektoré imunitné bunky. Analogický orgán u mnohých ďalších druhov však má zrejmú funkciu. Okrem toho môže byť ľudský dodatok pozitívne nevýhodný v tom zmysle, že je vystavený nepríjemným infekciám, ktoré môžu byť fatálne.
Dodatok je pozostatkový orgán, pretože neslúži ako homologické orgány iných zvierat, aj keď môže slúžiť ľuďom. Otázka sa teda stáva, prečo majú ľudia dodatok? (Alebo prečo ľudský dodatok nefunguje ako homológny orgán u iných zvierat?) Evolúcia, myšlienka, že všetci máme spoločných predkov, poskytuje zmysluplnú odpoveď. Kreacionizmus nie.
